朱巴大學（英語：University of Juba），為南蘇丹首都朱巴的一所公立大學。主校區位於朱巴。朱巴大學成立於1975年，以適應蘇丹南部教育的需求，並於1977年招收第一批學生。
第二次蘇丹內戰期間(1983 - 2005)，該校遷往蘇丹首都喀土穆。2011年，南蘇丹獨立後，朱巴大學重返朱巴。
