開放閱讀框(英語:Open reading frame;縮寫:ORF;其他譯名:開放閱讀框架開放讀架等)是指在給定的閱讀框架中,不包含終止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中,可能作為蛋白質編碼序列的部分。基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間。由於一段DNARNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最有可能編碼蛋白質的序列。

樣品序列顯示三種不同的可能的閱讀框。 起始密碼子以紫色突出顯示,而終止密碼子以紅色突出顯示。

例子

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一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法:

  1. UCU AAA GGU CCA
  2. CUA AAG GUC
  3. UAA AGG UCC

由於UAA為終止密碼子,因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力,故只有前兩者為開放閱讀框架。

找ORF的軟體

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在線尋找ORF的軟體:ORF Finder頁面存檔備份,存於網際網路檔案館

功能

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ORF Finder 被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。也可用於大規模的開放式閱讀框尋找。

參見

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外部連結

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