馬文卿（？—1639年），字瑞符，貴州貴陽人，明朝政治人物，同進士出身。
萬曆二十年（1592年）壬辰科進士，三甲二百三十六名，選翰林院庶吉士，二十九年九月授山西道御史，巡按直隸，又巡視邊關，巡按廣東，因被貶官而辭官回鄉。崇禎十二年（1639年）十一月卒於貴陽，著有《馬侍御稿》。
馬士英是他的侄子。
