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人类冠状病毒HKU1

人类冠状病毒HKU1（Human coronavirus HKU、HCoV-HKU1），是乙型冠状病毒属的一种病毒，可能是源于感染鼠类的病毒[1]，于2005年1月由香港大学的研究团队发表，在香港两名肺炎患者的鼻咽分泌物中发现[2]。

人类冠状病毒HKU1
被HKU1病毒感染的人类第二型肺泡细胞，可见病毒感染造成了细胞间的融合，产生合胞体。绿色部分为病毒刺突蛋白的染色，蓝色则为细胞核
病毒分类 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
种：
人类冠状病毒HKU1 Human coronavirus HKU1

HKU1病毒与同属的人类冠状病毒OC43以及甲型冠状病毒属的人类冠状病毒229E和人类冠状病毒NL63同为造成人类普通感冒的四种冠状病毒[3]，也是四种病毒中最晚被发现的。此病毒与OC43病毒一样以9-O-乙酰基唾液酸（9-O-acetylated sialic acids、9-O-Ac-Sias）为受体感染细胞[1][4]。

发现

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2004年一月，一名从深圳返回香港的71岁的男子，因咳嗽有痰与发烧而入院治疗，经胸部X光检查证实有肺炎症状，其鼻咽分泌物的数种病毒检测均呈阴性，经检验发现新型的冠状病毒HKU1。该名男子在入院五天后因症状缓解而出院。后来研究人员检查样本发现另一名35岁、有肺炎症状的妇人鼻咽分泌物中亦有此病毒[5]。

由于HCoV-HKU1的检出率低，导致学界对其认知有限。巴西研究人员于2011年宣布在一名于1995年冷冻的儿童鼻咽拭子样本中找到HCoV-HKU1，使得HCoV-HKU1的记录提前到1995年，并且研究人员通过进化树分析认为病毒早期可能存在其它分支[6] 。

基因组

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人类冠状病毒HKU1的基因组约长30000nt，其GC含量仅32%，是冠状病毒中GC比最低者。其基因组编码冠状病毒皆有的复制酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）与衣壳蛋白（N）等四种结构蛋白，此外还有血凝素酯酶（英语：hemagglutinin esterase）（HE）与ORF4和ORF8两个开放阅读框编码辅助蛋白，其基因顺序为1ab-HE-S-ORF4-E-M-N-ORF8，其中ORF8的开放阅读框位于衣壳蛋白的开放阅读框之内[5]。

感染

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冠状病毒感染细胞之前，其刺突蛋白一般需被宿主细胞的蛋白酶切割，使其介导病毒外膜和细胞膜融合的结构域露出以利感染。HKU1病毒刺突蛋白中具有一S1/S2切割位点，可能可以被弗林蛋白酶切割[7]。此病毒感染的潜伏期为2–4天[8]，在冬季较多[2]，造成的症状通常包括流鼻水、发烧、咳嗽与喘息等，严重者可造成肺炎或细支气管炎（英语：bronchiolitis），另外有研究人员认为此病毒可能造成肠道症状[7][9]。还有研究显示被HKU1病毒感染的儿童发生热性痉挛的比例高于被其他呼吸道病毒感染者[2][10]。

分类

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乙型冠状病毒属中，人类冠状病毒HKU1与乙型冠状病毒1型、兔冠状病毒HKU14、中国鼠冠状病毒HKU24与鼠冠状病毒等共同组成一演化支支系A（lineage A），此演化支的病毒基因组中皆编码血凝素酯酶（HE），其他冠状病毒则无[11][12]。上述病毒中HKU1病毒可能与鼠冠状病毒的关系较为接近，互为姊妹群，序列分析显示HKU1病毒曾与鼠肝炎病毒（鼠冠状病毒的一型）发生重组，另外不同基因型的HKU1病毒间亦有重组发生[8]。

参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang. Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions. Diseases. 2016-07-25, 4 (3) [2020-03-06]. ISSN 2079-9721. PMC 5456285  . PMID 28933406. doi:10.3390/diseases4030026. （原始内容存档于2020-06-04）. See Table 1. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Tse, H.; Tsoi, H.-w.; Cheng, V. C. C.; Lee, P.; Tang, B. S. F.; Cheung, C. H. Y.; Lee, R. A.; So, L.-y.; Lau, Y.-l.; Chan, K.-h.; Yuen, K.-y. Coronavirus HKU1 and Other Coronavirus Infections in Hong Kong. Journal of Clinical Microbiology. 2006, 44 (6): 2063–71. PMC 1489438  . PMID 16757599. doi:10.1128/JCM.02614-05. 
  3. ^ Human Coronavirus Types. Centers for Disease Control and Prevention. 2020-02-15 [2020-03-25]. （原始内容存档于2020-02-04）. 
  4. ^ Hulswit, Ruben J. G.; Lang, Yifei; Bakkers, Mark J. G.; Li, Wentao; Li, Zeshi; Schouten, Arie; Ophorst, Bram; van Kuppeveld, Frank J. M.; Boons, Geert-Jan; Bosch, Berend-Jan; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Human coronaviruses OC43 and HKU1 bind to 9-O-acetylated sialic acids via a conserved receptor-binding site in spike protein domain A. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2019, 116 (7): 2681–2690. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1809667116. 
  5. ^ 5.0 5.1 Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Chu, C.-m.; Chan, K.-h.; Tsoi, H.-w.; Huang, Y.; Wong, B. H. L.; Poon, R. W. S.; Cai, J. J.; Luk, W.-k.; Poon, L. L. M.; Wong, S. S. Y.; Guan, Y.; Peiris, J. S. M.; Yuen, K.-y. Characterization and Complete Genome Sequence of a Novel Coronavirus, Coronavirus HKU1, from Patients with Pneumonia. Journal of Virology. 2004, 79 (2): 884–95. PMC 538593  . PMID 15613317. doi:10.1128/JVI.79.2.884-895.2005. 
  6. ^ 刘培林; 史蕾; 顾大勇; 胡龙飞. 人冠状病毒HCoV-HKU1研究进展. 中国公共卫生. 2017, 33 (8) [2020-04-07]. （原始内容存档于2020-04-07）. 
  7. ^ 7.0 7.1 Pyrc, K.; Berkhout, B.; van der Hoek, L. The Novel Human Coronaviruses NL63 and HKU1. Journal of Virology. 2006, 81 (7): 3051–3057. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01466-06. 
  8. ^ 8.0 8.1 Su, Shuo; Wong, Gary; Shi, Weifeng; Liu, Jun; Lai, Alexander C.K.; Zhou, Jiyong; Liu, Wenjun; Bi, Yuhai; Gao, George F. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses. Trends in Microbiology. 2016, 24 (6): 490–502. ISSN 0966-842X. doi:10.1016/j.tim.2016.03.003. 
  9. ^ Vabret, A.; Dina, J.; Gouarin, S.; Petitjean, J.; Corbet, S.; Freymuth, F. Detection of the New Human Coronavirus HKU1: A Report of 6 Cases. Clinical Infectious Diseases. 2006, 42 (5): 634–639. ISSN 1058-4838. doi:10.1086/500136. 
  10. ^ Kelvin K. W. To, Ivan F. N. Hung, Jasper F. W. Chan, Kwok-Yung Yuen. From SARS coronavirus to novel animal and human coronaviruses 5. Journal of Thoracic Disease. 2013. doi:10.3978/j.issn.2072-1439.2013.06.02. 
  11. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738  . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1). 
  12. ^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14. 
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