严重急性呼吸综合征冠状病毒2阿尔法变异株
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2-阿尔法变异株(英语:SARS-CoV-2 Alpha variant),别名B.1.1.7谱系(英语:Lineage B.1.1.7),是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的一种变异株,世界卫生组织将其列为“高关注变异株”(VOC),原因是其传播性较严重的严重急性呼吸综合征冠状病毒2高70%[2](香港大学团队估算传播力高75%[3])。2020年11月2019冠状病毒病英国疫情期间,此变种病毒在9月首次从英国采集的样本中发现,并在12月中旬开始在该国快速传播[4]。
阿尔法 | |
一般细节 | |
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世卫组织指称 | Alpha |
谱系 | B1.1.1.7 |
首次检测到 | 英格兰肯特郡 |
报告日期 | 2020年11月 |
地位 | 需要关注的变异株 |
症状 | |
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病例地图 | |
主要变异株 | |
根据英格兰公共卫生署2021年8月报告,2月至8月阿尔法变异株病例死亡率1.1%,新版德尔塔变异株则0.3%(如只计无注射疫苗则0.21%)[5]。
名称
编辑此变种病毒有多个名称,在英国境外有时称之为英国变种病毒[6](英语:U.K. variant 或 British variant)。在英国,因为此变种病毒首先在肯特郡被发现,所以在之后将其称为肯特郡变种病毒(英语:Kent variant)[7]。
在科学用途中,此变种病毒起初被命名为VUI-202012/01(英语:First Variant Under Investigation in December 2020,意为“2020年12月首个被调查的变种”)[8],但在2020年12月21日发布的报告中,英格兰公共卫生部将其重新归类为值得关注的变种病毒[9]。在代表新冠病毒基因组学英国联盟(COG-UK)撰写的报告中,他们根据PANGOLIN的系统将其命名为B.1.1.7谱系。[10]
2021年5月31日,世界卫生组织为几种主要的变异病毒株以希腊字母命名,以避免地名命名导致污名化的问题,其中B.1.1.7命名为Alpha,世卫表示此命名并不会取代科学名称。[11]此后中国大陆媒体往往据此将其音译为阿尔法毒株。台湾则直接称作Alpha变异株。
遗传图谱
编辑SARS-CoV-2的突变是常见的:根据英国COVID-19基因组学联盟的数据,仅在其刺突蛋白中就检测到4000多个突变[13]。
探测
编辑属于B.1.1.7谱系的两个最早的基因组分别于2020年9月20日在肯特郡和9月21日在大伦敦采集[10]。这些序列被提交到全球共享流感数据倡议组织(GISAID)序列数据库(序列登录名分别为EPI_ISL_601443和EPI_ISL_581117)。截至12月15日,B.1.1.7谱系共有1623个基因组。其中519个样本在大伦敦,555个在肯特郡,545个在英国其他地区(包括苏格兰和威尔士),4个在其他国家/地区[10]。
使用遗传证据进行的反向追踪表明,这一新变种于2020年9月出现,然后以极低的水平在人群中传播,直到11月中旬。11月下旬,当英国公共卫生局(PHE)正在调查为何肯特郡的感染率尽管受到国家限制而没有下降时,发现了与该新变种有关的病例。随后,PHE发现一个与这种变异体有关的簇(cluster)正在迅速蔓延到伦敦和埃塞克斯郡[14]。
症状
编辑根据伦敦帝国理工学院对英格兰100多万人进行的社区传播实时评估(REACT)研究,发现阿尔法变异株的一系列与COVID-19相关的额外症状,其中发冷、食欲不振、头痛和肌肉酸痛是最典型的症状。[15][需要可靠医学来源]
参见
编辑参考文献
编辑- ^ B.1.1.7 report. cov-lineages.org. [2021-01-29].
- ^ 成依华. 英國疫情|約翰遜:新變種病毒株傳播力高70% 提升倫敦防疫級別. 香港01. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-05-02).
- ^ 陈乐彤. 新冠肺炎|英國變種病毒N501Y傳播力高75% 入侵香港恐令疫情失控【拆解7大常見Q&A】. 晴报. 2020-12-21 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-04-30).
- ^ Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK. BBC News. 2020-12-20 [2020-12-24]. (原始内容存档于2020-12-21).
- ^ SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England Technical Briefing 21 (PDF). Public Health England: 11. 2021-08-20 [2021-07-19]. (原始内容存档 (PDF)于2021-07-23) (英语).
- ^ Boseley, Sarah. Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist. The Guardian. 10 February 2021 [10 February 2021]. (原始内容存档于2021-05-01).
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- ^ PHE investigating a novel strain of COVID-19. Public Health England. 2020-12-14 [2020-12-24]. (原始内容存档于2021-12-15).
- ^ Variants: distribution of cases data. GOV.UK. At "Differences between a Variant of Concern and Varaint Under Investigation". 2021-01-28 [2021-02-19]. (原始内容存档于2021-06-07).
- ^ 10.0 10.1 10.2 Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; Connor, Tom; Peacock, Tom; L. Robertson, David; Volz, Erik. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations (报告). Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. 2020-12-19 [2020-12-20]. (原始内容存档于2020-12-21).
- ^ 徐榆涵. 避免汙名化!WHO宣布:改用希臘字母稱呼變種病毒. 联合报 (联合新闻网). 2021-06-01 [2021-06-01]. (原始内容存档于2021-06-03).
- ^ Spike Variants: 阿尔法 variant, aka B.1.1.7, 501Y.V1, 20I/501Y.V1, and UK COVID variant (页面存档备份,存于互联网档案馆) 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021
- ^ Wise, Jacqui. Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK. BMJ. 2020-12-16, 371: m4857. PMID 33328153. S2CID 229291003. doi:10.1136/bmj.m4857 .
- ^ COVID-19 (SARS-CoV-2): information about the new virus variant. Gov.uk. Public Health England. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-12-20).
- ^ Roberts, Michelle. Headache and runny nose linked to Delta variant. BBC. 2021-06-14 [2021-09-23]. (原始内容存档于2022-01-03) (英语).