严重急性呼吸综合征冠状病毒2-Alpha变异株

SARS-CoV-2的變異株

严重急性呼吸综合征冠状病毒2-Alpha变异株(英语:SARS-CoV-2 Alpha variant),别名B.1.1.7谱系(英语:Lineage B.1.1.7),是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的一种变异株,世界卫生组织将其列为“高关注变异株”(VOC),原因是其传播性较严重的严重急性呼吸综合征冠状病毒2高70%[2]香港大学团队估算传播力高75%[3])。2020年11月2019冠状病毒病英国疫情期间,此变种病毒在9月首次从英国采集的样本中发现,并在12月中旬开始在该国快速传播[4]

SARS-CoV-2 变异株
Alpha
科学上准确的SARS-CoV-2的外部结构的原子模型。每个“球”都是一个原子。
科学上准确的SARS-CoV-2的外部结构的原子模型。每个“球”都是一个原子。
一般细节
世卫组织指称Alpha
谱系B1.1.1.7
首次检测到英格兰肯特郡
报告日期2020年11月,​4年前​(2020-11
地位需要关注的变异株英语Variant of concern
症状
  • 发冷
  • 食欲不振
  • 头痛
  • 肌肉疼痛
病例地图
截至2021年3月25日各地确诊B.1.1.7谱系的总数[1]
图示:
  超过10,000个确诊个案
  5,000–9,999个确诊个案
  1,000–4,999个确诊个案
  500–999个确诊个案
  100–499个确诊个案
  2–99个确诊个案
  1个确诊个案
  无确诊个案或无数据
主要变异株

根据英格兰公共卫生署2021年8月报告,2月至8月Alpha变异株病例死亡率1.1%,新版Delta变异株则0.3%(如只计无注射疫苗则0.21%)[5]

名称

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此变种病毒有多个名称,在英国境外有时称之为英国变种病毒[6](英语:U.K. variant 或 British variant)。在英国,因为此变种病毒首先在肯特郡被发现,所以在之后将其称为肯特郡变种病毒(英语:Kent variant[7]

在科学用途中,此变种病毒起初被命名为VUI-202012/01(英语:First Variant Under Investigation in December 2020,意为“2020年12月首个被调查的变种”)[8],但在2020年12月21日发布的报告中,英格兰公共卫生部英语Public Health England将其重新归类为值得关注的变种病毒[9]。在代表新冠病毒基因组学英国联盟英语COVID-19 Genomics UK Consortium(COG-UK)撰写的报告中,他们根据PANGOLIN的系统将其命名为B.1.1.7谱系。[10]

2021年5月31日,世界卫生组织为几种主要的变异病毒株以希腊字母命名,以避免地名命名导致污名化的问题,其中B.1.1.7命名为Alpha,世卫表示此命名并不会取代科学名称。[11]此后中国大陆媒体往往据此将其音译阿尔法毒株。台湾则直接称作Alpha变异株

遗传图谱

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SARS-CoV-2的突变是常见的:根据英国COVID-19基因组学联盟英语COVID-19 Genomics UK Consortium的数据,仅在其棘蛋白中就检测到4000多个突变[13]

探测

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属于B.1.1.7谱系的两个最早的基因组分别于2020年9月20日在肯特郡和9月21日在大伦敦采集[10]。这些序列被提交到全球共享流感数据倡议组织(GISAID)序列数据库(序列登录名分别为EPI_ISL_601443和EPI_ISL_581117)。截至12月15日,B.1.1.7谱系共有1623个基因组。其中519个样本在大伦敦,555个在肯特郡,545个在英国其他地区(包括苏格兰威尔士),4个在其他国家/地区[10]

使用遗传证据进行的反向追踪表明,这一新变种于2020年9月出现,然后以极低的水平在人群中传播,直到11月中旬。11月下旬,当英国公共卫生局英语Public Health England(PHE)正在调查为何肯特郡的感染率尽管受到国家限制而没有下降时,发现了与该新变种有关的病例。随后,PHE发现一个与这种变异体有关的簇(cluster)正在迅速蔓延到伦敦埃塞克斯郡[14]

症状

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根据伦敦帝国理工学院英格兰100多万人进行的社区传播实时评估(REACT)研究,发现Alpha变异株的一系列与COVID-19相关的额外症状,其中发冷食欲不振头痛肌肉酸痛是最典型的症状。[15][需要可靠医学来源]

参见

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参考文献

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  1. ^ B.1.1.7 report. cov-lineages.org. [2021-01-29]. 
  2. ^ 成依华. 英國疫情|約翰遜:新變種病毒株傳播力高70% 提升倫敦防疫級別. 香港01. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-05-02). 
  3. ^ 陈乐彤. 新冠肺炎|英國變種病毒N501Y傳播力高75% 入侵香港恐令疫情失控【拆解7大常見Q&A】. 晴报. 2020-12-21 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-04-30). 
  4. ^ Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK. BBC News. 2020-12-20 [2020-12-24]. (原始内容存档于2020-12-21). 
  5. ^ SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England Technical Briefing 21 (PDF). Public Health England: 11. 2021-08-20 [2021-07-19]. (原始内容存档 (PDF)于2021-07-23) (英语). 
  6. ^ Boseley, Sarah. Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist. The Guardian. 10 February 2021 [10 February 2021]. (原始内容存档于2021-05-01). 
  7. ^ Boseley, Sarah. Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist. The Guardian. 2021-02-10 [2021-02-10]. (原始内容存档于2021-05-01). 
  8. ^ PHE investigating a novel strain of COVID-19. Public Health England. 2020-12-14 [2020-12-24]. (原始内容存档于2021-12-15). 
  9. ^ Variants: distribution of cases data. GOV.UK. At "Differences between a Variant of Concern and Varaint Under Investigation". 2021-01-28 [2021-02-19]. (原始内容存档于2021-06-07). 
  10. ^ 10.0 10.1 10.2 Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; Connor, Tom; Peacock, Tom; L. Robertson, David; Volz, Erik. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations (报告). Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. 2020-12-19 [2020-12-20]. (原始内容存档于2020-12-21). 
  11. ^ 徐榆涵. 避免汙名化!WHO宣布:改用希臘字母稱呼變種病毒. 联合报 (联合新闻网). 2021-06-01 [2021-06-01]. (原始内容存档于2021-06-03). 
  12. ^ Spike Variants: Alpha variant, aka B.1.1.7, 501Y.V1, 20I/501Y.V1, and UK COVID variant页面存档备份,存于互联网档案馆) 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021
  13. ^ Wise, Jacqui. Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK. BMJ. 2020-12-16, 371: m4857. PMID 33328153. S2CID 229291003. doi:10.1136/bmj.m4857 . 
  14. ^ COVID-19 (SARS-CoV-2): information about the new virus variant. Gov.uk. Public Health England. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-12-20). 
  15. ^ Roberts, Michelle. Headache and runny nose linked to Delta variant. BBC. 2021-06-14 [2021-09-23]. (原始内容存档于2022-01-03) (英语).