WIV16病毒
WIV16病毒（SL-CoV-WIV6）是严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV）的一个病毒株，与造成SARS事件的SARS-CoV全基因组序列相似度为96%，同使用ACE2为受体感染细胞，是迄今发现和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒，于2016年发表。
WIV16病毒
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病毒分类 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | |
| 毒株： | WIV16病毒 SL-CoV WIV16
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发现 编辑
WIV16病毒于2013年在云南昆明的中华菊头蝠粪便样本中发现并成功分离，其基因组长度为30290nt，与SARS-CoV的序列相似度为为96%，略高于WIV1病毒的95.6%和SHC014病毒的95.4%，是迄今发现和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒。另外此病毒刺突蛋白氨基酸序列和SARS-CoV的相似度为97%，也高于其他蝙蝠病毒与SARS-CoV的相似度，负责与宿主细胞受体ACE2结合的受体结合结构域（RBD）之氨基酸相似度则为95%，与WIV1相似；但其ORF8和SARS-CoV的相似度则较低，氨基酸序列相似度只有约40%[1]。WIV16病毒和WIV病毒在ORF6和ORF7之间皆有另一开放阅读框ORFX编码一辅助蛋白，为这两个病毒株所特有，可能可以抑制宿主细胞的干扰素β，并刺激NF-κB表现，进而调节宿主的免疫反应[2]。
SARS相关蝙蝠病毒中，仅有WIV16病毒与WIV1病毒被成功从样本中分离，并于体外细胞培养[1][2]。
演化树 编辑
截至2021年1月[update]，SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树：
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SARS-CoV-2 79 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
参考文献 编辑
- ^ 1.0 1.1 1.2 Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638
. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 （英语）.
- ^ 2.0 2.1 Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL; et al. Bat Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus WIV1 Encodes an Extra Accessory Protein, ORFX, Involved in Modulation of the Host Immune Response.. J Virol. 2016, 90 (14): 6573–6582. PMC 4936131 . PMID 27170748. doi:10.1128/JVI.03079-15.
- ^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380 . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w （英语）.
- ^ 4.0 4.1 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）.
- ^ 5.0 5.1 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 （英语）.
- ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus from Bats in China. Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348 . PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 （英语）.
- ^ 7.0 7.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176 . PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 （英语）.
- ^ 8.0 8.1 Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864 . PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 （英语）.
