WIV16病毒

WIV16病毒
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属：	SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：	SARSr-CoV
毒株：	WIV16病毒 SL-CoV WIV16

WIV16病毒（SL-CoV-WIV6）是严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV）的一个病毒株，与造成SARS事件的SARS-CoV全基因组序列相似度为96%，同使用ACE2为受体感染细胞，是迄今发现和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒，于2016年发表。

发现

WIV16病毒于2013年在云南昆明的中华菊头蝠粪便样本中发现并成功分离，其基因组长度为30290nt，与SARS-CoV的序列相似度为为96%，略高于WIV1病毒的95.6%和SHC014病毒的95.4%，是迄今发现和SARS-CoV序列相似度最高的蝙蝠病毒。另外此病毒刺突蛋白氨基酸序列和SARS-CoV的相似度为97%，也高于其他蝙蝠病毒与SARS-CoV的相似度，负责与宿主细胞受体ACE2结合的受体结合结构域（RBD）之氨基酸相似度则为95%，与WIV1相似；但其ORF8和SARS-CoV的相似度则较低，氨基酸序列相似度只有约40%^[1]。WIV16病毒和WIV病毒在ORF6和ORF7之间皆有另一开放阅读框ORFX编码一辅助蛋白，为这两个病毒株所特有，可能可以抑制宿主细胞的干扰素β，并刺激NF-κB表现，进而调节宿主的免疫反应^[2]。

SARS相关蝙蝠病毒中，仅有WIV16病毒与WIV1病毒被成功从样本中分离，并于体外细胞培养^[1]^[2]。

演化树

截至2021年1月 (2021-01)^[update]，SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树：

16BO133 与SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道（2016年采集、2019年发表）^[3]

	Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌（2004年采集、2005年发表）^[4]

	BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东（2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株）^[5]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山（2011年采集、2014年发表）^[6]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁（2004年采集、2005年发表）^[4]

	SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰（2013年采集、2015年发表）^[7]

	SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰（2013年采集、2015年发表）^[7]

	SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2011年采集、2013年发表）^[8]

	WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2012年采集、2013年发表）^[8]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2013年采集、2016年发表）^[1]

	果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东^[5]

	SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

蝙蝠病毒

果子狸病毒

人类病毒

参考文献

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638  . PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 （英语）.
^ ^2.0 ^2.1 Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL; et al. Bat Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus WIV1 Encodes an Extra Accessory Protein, ORFX, Involved in Modulation of the Host Immune Response.. J Virol. 2016, 90 (14): 6573–6582. PMC 4936131  . PMID 27170748. doi:10.1128/JVI.03079-15.
^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380  . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w （英语）.
^ ^4.0 ^4.1 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）.
^ ^5.0 ^5.1 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 （英语）.
^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus from Bats in China. Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348  . PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 （英语）.
^ ^7.0 ^7.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176  . PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 （英语）.
^ ^8.0 ^8.1 Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864  . PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 （英语）.

[pmid26719272-1] 1.0 ^1.1 ^1.2 Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa. Perlman, S. , 编. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016-03-15, 90 (6). ISSN 0022-538X. PMC 4810638  . PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15 （英语）.

[pmid27170748-2] 2.0 ^2.1 Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL; et al. Bat Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus WIV1 Encodes an Extra Accessory Protein, ORFX, Involved in Modulation of the Host Immune Response.. J Virol. 2016, 90 (14): 6573–6582. PMC 4936131  . PMID 27170748. doi:10.1128/JVI.03079-15.

[pmid31076983-3] Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. Virus Genes. 2019-08, 55 (4). ISSN 0920-8569. PMC 7089380  . PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w （英语）.

[Li2005-4] 4.0 ^4.1 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）.

[book2015-5] 5.0 ^5.1 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 （英语）.

[pmid24719429-6] He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; Xia, Lele; Zhou, Jihua; Zhen, Weibin; Feng, Ye; Guo, Huancheng. Perlman, S. , 编. Identification of Diverse Alphacoronaviruses and Genomic Characterization of a Novel Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus from Bats in China. Journal of Virology. 2014-06-15, 88 (12). ISSN 0022-538X. PMC 4054348  . PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14 （英语）.

[LauFeng2015-7] 7.0 ^7.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; Song, Zhi-Zhong; Chow, Wang-Ngai; Fan, Rachel Y. Y. Perlman, S. , 编. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015-10-15, 89 (20). ISSN 0022-538X. PMC 4580176  . PMID 26269185. doi:10.1128/JVI.01048-15 （英语）.

[2013Nature-8] 8.0 ^8.1 Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013-11, 503 (7477). Bibcode:2013Natur.503..535G. ISSN 0028-0836. PMC 5389864  . PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 （英语）.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]