传统上,遗传密码 以RNA密码子表 的形式表示;这是因为在细胞核糖体 制造蛋白质时,指导合成蛋白质 的是信使RNA 。信使RNA的序列则由基因组DNA 确定。随着计算生物学 和基因组学 的兴起,现今可在DNA水平上发现大多数基因,因此DNA密码子表 变得愈加有用。[ 1] 下表中的DNA密码子存在于有义DNA链 上,并以5'端→3'端的方向 排列。[ 2]
三个连续的DNA 碱基 ,称为核苷酸 的三联密码子。
标准遗传密码
碱基1
碱基2
碱基3
T
C
A
G
T
TTT
(Phe/F)
苯丙氨酸
TCT
(Ser/S)
丝氨酸
TAT
(Tyr/Y)
酪氨酸
TGT
(Cys/C)
半胱氨酸
T
TTC
TCC
TAC
TGC
C
TTA
(Leu/L)
亮氨酸
TCA
TAA[B]
终止 (赭石 )
TGA[B]
终止 (蛋白石 )
A
TTG
TCG
TAG[B]
终止 (琥珀 )
TGG
(Trp/W)色氨酸
G
C
CTT
CCT
(Pro/P)
脯氨酸
CAT
(His/H)
组氨酸
CGT
(Arg/R)
精氨酸
T
CTC
CCC
CAC
CGC
C
CTA
CCA
CAA
(Gln/Q)
谷氨酰胺
CGA
A
CTG
CCG
CAG
CGG
G
A
ATT
(Ile/I)
异亮氨酸
ACT
(Thr/T)
苏氨酸
AAT
(Asn/N)
天冬酰胺
AGT
(Ser/S)
丝氨酸
T
ATC
ACC
AAC
AGC
C
ATA
ACA
AAA
(Lys/K)
赖氨酸
AGA
(Arg/R)
精氨酸
A
ATG[A]
(Met/M)
甲硫氨酸
ACG
AAG
AGG
G
G
GTT
(Val/V)
缬氨酸
GCT
(Ala/A)
丙氨酸
GAT
(Asp/D)
天冬氨酸
GGT
(Gly/G)
甘氨酸
T
GTC
GCC
GAC
GGC
C
GTA
GCA
GAA
(Glu/E)
谷氨酸
GGA
A
GTG
GCG
GAG
GGG
G
A 密码子ATG同时编码甲硫氨酸并作为起始点:在信使RNA 的编码区里,首个ATG的出现标志着蛋白质翻译的开始。[ 3]
B ^ ^ ^ 标示终止密码子为琥珀、赭石和蛋白石的历史原因可在悉尼·布伦纳(Sydney Brenner )的自传[ 4] 和鲍勃·埃德加(Bob Edgar )的一篇历史性文章中找到。[ 5]
反向密码子表(使用IUPAC符号 缩写)
氨基酸
密码子
缩写
氨基酸
密码子
缩写
Ala/A
GCT、GCC、GCA、GCG
GCN
Leu/L
TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG
YTR、CTN
Arg/R
CGT、CGC、CGA、CGG、AGA、AGG
CGN、MGR
Lys/K
AAA、AAG
AAR
Asn/N
AAT、AAC
AAY
Met/M
ATG
Asp/D
GAT、GAC
GAY
Phe/F
TTT、TTC
TTY
Cys/C
TGT、TGC
TGY
Pro/P
CCT、CCC、CCA、CCG
CCN
Gln/Q
CAA、CAG
CAR
Ser/S
TCT、TCC、TCA、TCG、AGT、AGC
TCN、AGY
Glu/E
GAA、GAG
GAR
Thr/T
ACT、ACC、ACA、ACG
ACN
Gly/G
GGT、GGC、GGA、GGG
GGN
Trp/W
TGG
His/H
CAT、CAC
CAY
Tyr/Y
TAT、TAC
TAY
Ile/I
ATT、ATC、ATA
ATH
Val/V
GTT、GTC、GTA、GTG
GTN
起始
ATG
终止
TAA、TGA、TAG
TAR、TRA