兔冠狀病毒HKU14

发现于广州市场家兔体内的冠状病毒

兔冠狀病毒HKU14(Rabbit Coronavirus HKU14、RbCoV HKU14)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,在中國廣州市場中的家兔體內被發現,於2012年由香港大學的研究人員發表[1]

兔冠狀病毒HKU14
病毒分類 編輯
(未分級) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
門: 小核糖病毒門 Pisuviricota
綱: 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠狀病毒科 Coronaviridae
屬: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
種:
兔冠狀病毒HKU14 Rabbit Coronavirus HKU14

分類

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兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型鼠冠狀病毒人類冠狀病毒HKU1中國鼠冠狀病毒HKU24皆是乙型冠狀病毒屬支序A(lineage A)的病毒,此演化支的病毒基因組中皆編碼血細胞凝集素酯酶英語Hemagglutinin esterase(HE),其他冠狀病毒則無[2][3]。支序A中兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型的關係接近(較中國鼠冠狀病毒HKU24與乙型冠狀病毒1型的關係更為接近),因複製酶保守區域的胺基酸序列相似度小於90%而被認定是獨立物種[1],不過仍有研究者將其視為乙型冠狀病毒1型的一個分型[4]分子鐘分析顯示兔冠狀病毒HKU14是較近期才起源的病毒,可能於2002年左右才由共同祖先分支[1]

基因組

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兔冠狀病毒HKU14的基因組約長31000nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有血細胞凝集素酯酶英語Hemagglutinin esterase(HE)以及NS2a和NS5a兩種輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2a-HE-S-NS5a-E-M-N。乙型冠狀病毒屬支序A的病毒除人類冠狀病毒HKU1外,在1ab與HE間都有編碼輔助蛋白NS2a,不過兔冠狀病毒HKU14的NS2a並非像支序A的其他病毒一樣是單一開放閱讀框,而是斷裂成3–4個較小的開放閱讀框[1]

其他兔冠狀病毒

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1961年有北歐科學家發現用來培養梅毒螺旋體的兔子被未知病原感染,並偶爾造成死亡,1970年代此感染的死亡率一度高達七成,後來約翰霍普金斯大學研究證實此病原為冠狀病毒,但初步實驗結果顯示此病毒應屬甲型冠狀病毒屬,和兔冠狀病毒HKU14無關[1][5]

參考文獻

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  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Fan, R. Y. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. F.; Tsang, A. K. L.; Lai, K. K. Y.; Chan, K.-H.; Che, X.-Y.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y. Isolation and Characterization of a Novel Betacoronavirus Subgroup A Coronavirus, Rabbit Coronavirus HKU14, from Domestic Rabbits. Journal of Virology. 2012, 86 (10): 5481–5496. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06927-11. 
  2. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1). 
  3. ^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14. 
  4. ^ Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008. 
  5. ^ Small, J. David; Woods, Robert D. Relatedness of Rabbit Coronavirus to Other Coronaviruses 218: 521–527. 1987. ISSN 0065-2598. doi:10.1007/978-1-4684-1280-2_68.