轉譯後修飾

轉譯後修飾（英語：Post-translational modification，縮寫PTM；又稱後轉譯修飾）是指蛋白質在轉譯後的化學修飾。對於大部份的蛋白質來說，這是蛋白質生物合成的較後步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。

胰島素的轉譯後修飾之過程圖

蛋白質，或是多肽，是多條或一條氨基酸的鏈。當合成蛋白質時，20種不同的氨基酸會合併成為蛋白質。氨基酸的轉譯後修飾會附在蛋白質其他的生物化學官能團（如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物）、改變氨基酸的化學性質，或是造成結構的改變（如建立雙硫鍵），來擴闊蛋白質的功能。

再者，酶可以從蛋白質的N末端移除氨基酸，或從中間將肽鏈剪開。舉例來說，胰島素是肽的激素，它會在建立雙硫鍵後被剪開兩次，並在鏈的中間移走多肽前體，而形成的蛋白質包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。

其他修飾，就像磷酸化，是控制蛋白質活動機制的一部份。蛋白質活動可以是令酶活性化或鈍化。

加入官能團

轉譯後修飾包括以下加入官能團的反應：

• 乙酰化——通常於蛋白質的N末端加入乙酰。
• 烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。
  • 甲基化——烷基化中常見的一種，在賴氨酸、精氨酸等的側鏈氨基上加入甲基。
• 生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸酰化。
• 穀氨酸化——在穀氨酸與導管素及其他蛋白質之間建立共價鍵。
• 甘氨酸化——在一個至超過40種甘氨酸與導管素的C末端建立共價鍵。
• 糖化——將糖基加入天冬酰胺、羥離氨酸、絲氨酸或蘇氨酸，形成醣蛋白。
• 異戊二烯化——加入如法呢醇及四異戊二烯等異戊二烯。
• 硫辛酸化——附着硫辛酸的功能性。
• 磷酸泛酰巰基乙氨基化——像在脂肪酸、聚酮、非核醣體肽鏈及白氨酸的生物合成中，從乙酰輔酶A加入4'磷酸泛酰巰基乙氨基。
• 磷酸化——加入磷酸根至絲氨酸、酪氨酸、蘇氨酸或組氨酸。
• 硫酸化——將硫酸根加入至酪氨酸。
• 硒化
• C末端酰胺化

加入其他蛋白質或肽

• 干擾素活化基因化——與干擾素活化基因15（ISG15）蛋白質建立共價鍵。
• 小泛素相關修飾化——與小泛素相關修飾子蛋白建立共價鍵。
• 泛素化——與泛素建立共價鍵。

改變氨基酸的化學性質

• 瓜氨化——將精氨酸轉為瓜氨酸。
• 脫氨化——將穀氨醯胺轉為穀氨酸或將天冬酰胺轉為天冬氨酸。

結構改變

• 雙硫鍵——與兩個半胱氨酸的氨基酸建立共價鍵。
• 分解蛋白質——將蛋白質的肽鍵剪開。

數據庫與工具

Flowchart of the process and the data sources to predict PTMs.

蛋白質序列包含通過修飾酶識別的序列基序，並且可以在 PTM 數據庫中記錄或預測。 隨着發現大量不同的修改，需要在數據庫中記錄此類資訊。 PTM 資訊可以通過實驗手段收集，也可以從高質量、手動整理的數據中預測。 已經創建了許多數據庫，通常側重於某些分類群（例如人類蛋白質）或其他特徵。

資源列表

• PhosphoSitePlus （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） – 用於研究哺乳動物蛋白質翻譯後修飾的綜合資訊和工具數據庫
• ProteomeScout – 實驗性蛋白質和翻譯後修飾數據庫
• Human Protein Reference Database – 用於不同修飾和了解不同蛋白質、它們的類別以及與致病蛋白質相關的功能/過程的數據庫
• PROSITE – 包括網站在內的多種類型 PTM 的共識模式數據庫

工具

蛋白質及其 PTM 可視化軟件列表

• PyMOL——將一組常見的 PTM 引入蛋白質模型
• AWESOME – 查看單核苷酸多態性對 PTM 的作用的交互式工具
• Chimera – 可視化分子的交互式數據庫

案例

• 胰島素生產過程中二硫鍵的裂解和形成
• 作為轉錄調控的組蛋白PTM：染色質結構對 RNA 聚合酶的控制
• RNA聚合酶Ⅱ的 PTM 作為轉錄調控
• 多肽鏈的切割對凝集素特異性至關重要

外部連接

• dbPTM - database of protein post-translational modifications （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
• List of posttranslational modifications in ExPASy （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
• Browse SCOP domains by PTM （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） — from the dcGO database
• Statistics of each post-translational modification from the Swiss-Prot database
• AutoMotif Server - A Computational Protocol for Identification of Post-Translational Modifications in Protein Sequences
• Functional analyses for site-specific phosphorylation of a target protein in cells
• Detection of Post-Translational Modifications after high-accuracy MSMS
• Overview and descripition of commonly used post-translational modification detection techniques （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）