1999年中华职棒总冠军战是在1999年11月3日至11月9日，分别在台北市立棒球场、嘉义市立棒球场、新庄棒球场举行，采七战四胜制，由卫冕军味全龙（年度第三，季后挑战赛胜队）对决和信鲸（年度第一）。
本季总冠军赛第一场发生暴力事件，多人遭到驱逐出场与禁赛罚款。最终，味全龙再度下克上，以4：1击败和信鲸，成为中职史上第二支三连霸，同时也是中职第一支“总冠军战0轰但夺冠”的球队。
| 球队名称 |
１ |
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３ |
４ |
５ |
６ |
７ |
８ |
９ |
Ｒ |
Ｈ |
Ｅ
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| 味全龙队 |
1 |
1 |
0 |
0 |
1 |
0 |
0 |
1 |
1 |
5 |
11 |
1
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| 和信鲸队 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
5 |
4
|
- 胜利投手：何利西 败战投手：郝有力 救援成功：无
- 胜利打点：巴威特 全垒打：无 单场MVP：无
- 比赛时间：３小时２５分钟
- 比赛场地：台北棒球场
- 主审裁判：杨英二
- 观众人数：９７６１人
| 球队名称 |
１ |
２ |
３ |
４ |
５ |
６ |
７ |
８ |
９ |
Ｒ |
Ｈ |
Ｅ
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| 味全龙队 |
0 |
1 |
0 |
4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
5 |
7 |
1
|
| 和信鲸队 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
1 |
2 |
5 |
2
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- 胜利投手：盖瑞 败战投手：郭源治 救援成功：无
- 胜利打点：洪正钦 全垒打：无 单场MVP：无
- 比赛时间：２小时５２分钟
- 比赛场地：嘉义市棒球场
- 主审裁判：苏建文
- 观众人数：５５４３人
| 球队名称 |
１ |
２ |
３ |
４ |
５ |
６ |
７ |
８ |
９ |
Ｒ |
Ｈ |
Ｅ
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| 和信鲸队 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
2 |
0 |
0 |
0 |
2 |
5 |
2
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| 味全龙队 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
2 |
0 |
0 |
0 |
3 |
7 |
0
|
- 胜利投手：金德七 败战投手：郭李建夫 救援成功：哈威尔
- 胜利打点：黄煚隆 全垒打：陈连宏六局上 单场MVP：无
- 比赛时间：２小时５２分钟
- 比赛场地：台北棒球场
- 主审裁判：许福利
- 观众人数：６０９９人
| 球队名称 |
１ |
２ |
３ |
４ |
５ |
６ |
７ |
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９ |
Ｒ |
Ｈ |
Ｅ
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| 和信鲸队 |
2 |
0 |
1 |
0 |
2 |
0 |
0 |
0 |
1 |
6 |
9 |
2
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| 味全龙队 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
3 |
3
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- 胜利投手：何纪贤 败战投手：威伦 救援成功：无
- 胜利打点：李坤哲 全垒打：百乐三局上 单场MVP：无
- 比赛时间：２小时３０分钟
- 比赛场地：台北棒球场
- 主审裁判：许荣龙
- 观众人数：７５５５人
| 球队名称 |
１ |
２ |
３ |
４ |
５ |
６ |
７ |
８ |
９ |
Ｒ |
Ｈ |
Ｅ
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| 和信鲸队 |
0 |
2 |
2 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
4 |
5 |
0
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| 味全龙队 |
0 |
0 |
0 |
0 |
2 |
0 |
0 |
1 |
2X |
5 |
12 |
1
|
- 胜利投手：李威 败战投手：马来宝 救援成功：无
- 胜利打点：陈金茂 全垒打：阙树木二局上 单场MVP：无
- 比赛时间：２小时５２分钟
- 比赛场地：新庄棒球场
- 主审裁判：叶曜荣
- 观众人数：６６４７人
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