阿尔泰办事长官是中华民国初年于阿尔泰设置的地方办事长官。
1912年中华民国成立后,改阿尔泰办事大臣为阿尔泰办事长官,驻承化寺。其辖地又称“阿尔泰区域”,直属于中华民国国务院。但阿尔泰地方屡受俄国、外蒙古军队侵扰,赖新疆省军队支援才得以保全。1919年,北洋政府改阿尔泰为阿山道,并入新疆省。阿尔泰办事长官改为阿山道尹,首任道尹为周务学。