阿爾泰辦事大臣是中國清代末年於阿爾泰地方設置的駐劄大臣。光緒三十二年十二月(1907年初))由科布多參贊大臣之副職科布多辦事大臣改置,駐承化寺。首任大臣為錫恆。以科布多參贊大臣所轄之阿爾泰烏梁海七旗、新土爾扈特二旗、新和碩特旗[a]為阿爾泰辦事大臣轄地。其地北至奎屯山、科布多河,東至阿爾泰山東麓、布爾根河,接科布多地界;西南至額爾齊斯河、布倫托海與新疆塔爾巴哈臺為界。大致相當於今新疆阿勒泰地區大部、蒙古國科布多省南部和巴彥烏列蓋省。
1912年中華民國成立後,改阿爾泰辦事大臣為阿爾泰辦事長官。