杜長城生於綏遠省包頭市,曾從事商人保鑣工作。1939年3月入國民政府軍事委員會調查統計局軍統蘭州訓練班二期,擅長爆破技術。
第二次國共內戰期間,杜長城於四平街保衛戰得了首功,由少校隊長破格晉升三級成為少將國防部保密(情報)局技術總隊總隊長。國軍撤離大陸之後,技術總隊設計出遇敵自動爆炸的多種海上詭雷,杜長城獲得參謀總長周至柔的賞識及進一步重用。
然而杜長城後來恃寵而驕,涉嫌走私黄金及綁架蔣經國案,遭到逮捕起訴。時任總統蔣介石批示“整肃军统,着令将杜长城枪毙”[1]。杜長城於1951年11月19日遭判處死刑,22日槍斃。