公孫昆邪(?—?),又作公孫渾邪。西漢北地郡義渠縣(今甘肅省慶陽市、涇川縣一帶)人。
公孫昆邪是義渠人,義渠多定居於隴西郡、北地郡、上郡。原為匈奴人,漢文帝時公孫昆邪歸漢。漢景帝三年(前154年),擔任將軍從周亞夫攻打吳、楚,平定七國之亂,以功拜為隴西郡太守。次年四月,封平曲侯,官至典屬國。漢景帝中四年(前146年)犯法失侯,免為庶人。著書十餘篇,《漢書·藝文志》記載有《公孫渾邪》十五篇,屬陰陽家。他的兒子(《漢書》作孫子)公孫賀。
公孫昆邪是義渠後代,原為匈奴人,名稱與匈奴昆邪王相同。中華人民共和國學者林梅村認為他可能來自於昆邪王部落。