青衣天后古廟歷經兩次遷址。最早期的廟址位於荃灣聖溪灣,又稱三百錢(今荃灣海濱花園旁),即青荃橋之下,因廟牆為白色,故稱為「白廟」。鄉民在該處響鐘時,對岸一處卻發出回音,故於清朝乾隆六年(1741年)將該廟遷往此地,即青衣警署現址。該廟曾於1926年及1962年重修。1983年,政府發展青衣島,並選擇在廟址興建青衣警署,該廟再南遷到現址。為免警署影響廟宇風水,新廟還耗資24萬港元加建噴水池、假石山和牌樓。
青衣天后誕慶祝天后誕的活動於農曆四月初一至初五舉行,包括表演中國傳統大戲及花炮比賽,近年也設有夜市。