醣生物學
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醣生物學(英語:Glycobiology),在最狹義的意義上是對自然界廣泛分布的醣類(醣鏈或聚醣)的結構,生物合成和生物學的研究[1][2]。糖或醣類是所有生物的重要組成部分,在各種醫學,生物化學和生物技術領域被研究生物學中扮演各個角色。
聚醣
編輯生物大分子共分為四大類別:核酸、蛋白質、脂類、及醣類。聚醣(3)具有一定的特性,其分子結構千變萬化,既有低聚醣也有多聚醣、既可呈直線型又可呈枝狀結構,其單體可通過多種不同組合形式連接。
醣體
醣體代表生物體內的所有醣苷組合,它可歸屬於某個器官或某類細胞。醣體的複雜程度遠超蛋白質體,因為它是基本組成物質之間各式結構變化及多種連接結合的產物。
聚醣(4)
基於其分子內的羥基群在空間內的排列架構,單醣以多個立體異構物的形式呈現。羥基群的位置決定醣類分子間的連接性質。羥基可被羧基、胺基或N-乙醯基取代。
聚醣通常分為以下四大類別:
- 葡萄糖、半乳糖及果糖等單醣。該類別由單一分子構成,不能水解,呈晶體狀。
- 麥芽糖、乳糖及蔗糖等雙醣
- 低聚醣及多聚醣,是由醣苷鍵連接的重複單元,可形成鏈式或分支結構,通常可水解。
- 複雜型低聚醣,為非重複單元,通常與蛋白質或脂類結合。
聚醣這一分子類別此前僅被視作提供能量的結構性組分。直到近年來,人們才開始重視其在生命體內的結構和功能。如今已有研究表明,通過在細胞表面與脂類及蛋白質進行結合,聚醣可參與到細胞間傳遞活動中。正因為有了聚醣,蛋白質在細胞內的分配才得以有效控制,生命體中的各類細胞才會有所區隔。
醣體學
編輯「類似於基因組學和蛋白質體學的醣體學是對給定細胞類型或生物體的所有聚醣結構的系統研究」,並且它是醣生物學的一個子集 [3][4]。
醣結構研究中的挑戰
編輯在糖結構中看到的部分變異性是因為單醣單元可以以許多不同的方式彼此偶聯,與蛋白質的胺基酸或DNA中的核苷酸相反,它們總是以標準方式偶聯在一起[5]。 由於缺乏生物合成的直接模板,聚醣結構的研究也變得複雜,與蛋白質的情況相反,蛋白質的胺基酸序列由其相應的基因決定[6]。
聚醣是次級的基因產物,因此通過細胞亞細胞區室中許多酶的協同作用產生。 由於聚醣的結構可能取決於不同生物合成酶的表現,活性和可接近性,因此不可能使用重組DNA技術來產生大量用於結構和功能研究的聚醣,就像蛋白質一樣。
醣生物學與醫療(5)
編輯市場上現有的肝素、促紅血球生成素及一些抗流感方面的新型藥物已凸顯出聚醣的效用和重要性。此外,醣生物學更是為抗癌藥品的研發提供了全新的可能性(6)。各類對抗癌症、炎症以及傳染性疾病的方法如今已進入臨床試驗階段,可為現存治療方式提供支持和補充。儘管聚醣由於結構過於複雜而很難進行合成複製,但這一嶄新的研究領域在未來擁有巨大潛力。
醣生物學與皮膚
編輯醣生物學隨著近年來科技的不斷進步而得到深入研究,也令人們對其與皮膚老化問題的關聯有了更為明確的認知。
如今已有研究結果清楚表明,聚醣是皮膚的主要組成成分,並在維持皮膚的動態平衡方面起決定性作用。其主要影響包括:
- 在分子及細胞辨識過程中扮演關鍵角色:聚醣可停留在細胞表面以傳遞生理資訊(7);
- 干預細胞的新陳代謝:合成、增殖、分化......
- 參與肌膚紋理構造。
作為皮膚活動必不可少的組成部分,聚醣在皮膚老化過程中將發生數量與質量上的雙重變化(8)。皮膚的運動及代謝功能將逐漸減緩,使肌膚暗沉、失去光澤。
參考文獻
編輯1. Varki A, Cummings R, Esko J, Freeze H, Stanley P, Bertozzi C, Hart G, Etzler M (2008). 《醣生物學要點》,[7] Laboratory出版社,第2版。ISBN 0-87969-770-9. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=glyco2 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館).
2. Varki A, Cummings R, Esko J, Freeze H, Hart G, Marth J (1999). 《醣生物學要點》,Cold Spring Harbor Laboratory出版社。ISBN 0-87969-560-9. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=glyco.TOC&depth=2 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館).
3. Rademacher TW, Parekh RB 及 Dwek RA. (1988). “糖生物学”,《生物化学年报》。.57 (1): 785–838. doi:10.1146/annurev.bi.57.070188.004033. PMID 3052290.
4. Olden K, Bernard BA, Humphries M及其他作者 (1985). 「醣蛋白聚醣的功能」,T.I.B.S., 2月, 78-82.
5. Pohlmann, 「醣生物學:醫學新武器?」,紀錄片,ZDF, 2007,43分鐘。http://video.google.com/videoplay?docid=-7663079290156002221# (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
6. https://web.archive.org/web/20130530025337/http://falling-walls.com/lectures/peter-seeberger/
7. Faury, G.,Ruszova,E.,Molinari,J.,Mariko,B.,Raveaud,S.,Velebny,V.,Robert,L., 「L-鼠李糖作為識別人類真皮成纖維血凝素的信號傳感器」,Ca++流量調控及基因表現,《生物化學及生物物理學研究》,2008, 1780,1388–1394.
8. Jang-Hee Oh, Yeon Kyung Kim, Ji-Yong Jung, Jeong-eun Shin, Jin Ho Chung,「葡萄糖胺聚醣及相關蛋白聚醣於老年人皮膚之上的變化」,《實驗皮膚學》,2011.
參考文獻
編輯- ^ Varki A, Cummings R, Esko J, Freeze H, Stanley P, Bertozzi C, Hart G, Etzler M. Essentials of glycobiology. Essentials of Glycobiology (Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2nd edition). 2008 [2014-12-08]. ISBN 0-87969-770-9. (原始內容存檔於2010-08-06).
- ^ Varki A, Cummings R, Esko J, Freeze H, Hart G, Marth J. Essentials of glycobiology. Essentials of glycobiology (Cold Spring Harbor Laboratory Press). 1999 [2014-12-08]. ISBN 0-87969-560-9. (原始內容存檔於2007-10-24).
- ^ Cold Spring Harbor Laboratory Press (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館) Essentials of Glycobiology, Second Edition
- ^ Schnaar, RL. Glycobiology simplified: diverse roles of glycan recognition in inflammation.. Journal of leukocyte biology. June 2016, 99 (6): 825–38. PMC 4952015 . PMID 27004978. doi:10.1189/jlb.3RI0116-021R.
- ^ Kreuger, J. Decoding heparan sulfate. 2001 [2008-01-11]. (原始內容存檔於2021-01-09).
- ^ Marth, JD. A unified vision of the building blocks of life. Nature Cell Biology. 2008, 10 (9): 1015–6. PMC 2892900 . PMID 18758488. doi:10.1038/ncb0908-1015.
- ^ Varki A, Cummings R, Esko J, Freeze H, Stanley P, Bertozzi C, Hart G, Etzler M. Cold Spring Harbor. 醣生物學要點. [2014-12-08]. (原始內容存檔於2010-08-06).
外部連結
編輯- (英文)供應商糖綴合物、聚醣辨識蛋白 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- (英文)功能糖組學網關 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館). 每月更新的網路資源,由「自然」和功能性糖組學聯盟合作。
- (英文)Carolyn Bertozzi 的研討會:「化學醣生物學」 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- (英文)Emanual Maverakis; et al. Glycans in the immune system and The Altered Glycan Theory of Autoimmunity (PDF).
- http://www.healthcanal.com/medical-breakthroughs/22037-UGA-scientists-team-define-first-ever-sequence-biologically-important-carbohydrate.html (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)